巫山站规划为郑万铁路重庆市境内唯一县级始发站，设计每日分别有一趟至重庆、北京的始发列车和以巫山作为终点的靠站过夜列车。以车站为核心的城市综合体规划为国内唯一集高速铁路、高速公路、机场、旅游码头四维一体的综合交通换乘中心。站房面积12000平方米，采用线下式布局，旅客进出站采用“下进下出”方式。年运行能力6000万人次。规划2030年开120对列车，届时每6分钟就有一列列车经过巫山站。

郑万铁路巫山站及站前广场项目工程位于桂花村，站前广场面积约10000平方米，社会停车场及景观绿化面积22005平方米，项目总建筑面积68288平方米。其中的基础配套设施包括场平、边坡防护、ABC区建筑结构装饰、车库出入口、道路、电气（低压配电柜出线端至末端全部内容）、给排水、消防、暖通、人防结构及预埋件、照明、静态标识、抗震支架等。

目前已经已完成盲沟、清表、土石方开挖及回填、旋挖桩基工程，接下来将进行通讯道路方面、边坡格构、路面、排水、管网及路灯工程，整个郑万铁路巫山站及配套设施项目，计划于今年8月完成。